Порядок нарахування, утримання, перерахування до бюджету підприємствами, установами і організаціями усіх форм власності прибуткового податку з громадян регулюється декретом Кабінету Міністрів України від 26 грудня 1992 року N 13-92 "Про прибутковий податок з громадян" (із змінами і доповненнями). Цим декретом передбачається після закінчення календарного року подання громадянами (крім тих, які одержували доходи лише за місцем основної роботи) до податкового органу за місцем проживання декларації про суми сукупного доходу, одержаного як за основним, так і неосновним місцем роботи.

Перерахування до бюджету прибуткового податку з громадян здійснюється за принципом територіального розташування підприємств, установ і організацій усіх форм власності та фізичних осіб - суб'єктів підприємницької діяльності, які здійснюють виплати доходів і на які покладено обов'язок нарахування, утримання і перерахування до бюджету прибуткового податку.

Зарахування до відповідних бюджетів прибуткового податку з громадян має здійснюватись за встановленими у статтях 65 і 66 Бюджетного кодексу України нормативними відрахуваннями, а саме прибутковий податок з громадян, який справляється на території міст республіканського (в Автономній Республіці Крим) та обласного значення, зараховується в обсязі 75 відсотків до бюджету місцевого самоврядування, а 25 відсотків - до бюджету Автономної Республіки Крим та обласного бюджету.

На виконання вимог статті 78 Бюджетного кодексу України наказом Державної скарбниці України від 31 січня 2002 р. N 17 затверджено Порядок казначейського обслуговування місцевих бюджетів за доходами та перерахування міжбюджетних трансфертів. Згідно з пунктом 2.1 цього наказу однією із функцій Державної скарбниці є повернення надмірно та/або помилково сплачених до місцевих бюджетів платежів на підставі висновків органів виконавчої влади, яким відповідно до закону надано право стягнення до бюджету податків, зборів (обов'язкових платежів) та інших надходжень. Державна скарбниця з рахунків, відкритих для місцевих бюджетів, передовсім здійснює повернення надмірно та/або помилково сплачених платежів і лише після цього проводить розмежування надходжень податків і зборів між місцевими бюджетами.