Департаментом відомчого контролю ДПАУ та регіональними підрозділами відомчого контролю у січні - жовтні 2009 р. здійснювались заходи внутрішнього контролю за роботою органів ДПС, підприємств, установ та організацій, заснованих за їх участі, щодо виконання ними вимог чинного законодавства та розпорядчих документів ДПАУ.

1. За 10 місяців 2009 р. Департаментом проведено та взято участь у 523 перевірках. Зокрема, проведено 4 комплексні перевірки, 4 перевірки виконання кошторису видатків, 3 - оперативно-службової діяльності, 9 - підвідомчих підприємств, 41 - тематична, 9 - усунення раніше виявлених порушень, 8 службових розслідувань. До 440 посадових осіб, з вини яких були допущені порушення, застосовані заходи впливу, з яких до 105 застосовано дисциплінарні стягнення та до 335 - інші стягнення. Проте матеріали перевірок та окремі показники зведеної інформації свідчать про низьку ефективність проведення в окремих регіонах внутрішнього контролю через недостатню підготовленість до проведення певних видів перевірок та поверхове їх проведення.

Здійснення органами ДПС організаційних і практичних заходів для забезпечення виконання дохідної частини бюджету потребує проведення поглибленого внутрішнього контролю за діяльністю як регіональних ДПА та місцевих ДПІ, так і їх структурних підрозділів, надання об'єктивної оцінки та практичної допомоги щодо запровадження нових підходів в роботі з платниками податків і підвищенні якісного рівня забезпечення бюджетних призначень.

Як показали матеріали проведених лише у вересні - жовтні 2009 р. на виконання доручень Департаменту перевірок органів ДПС з питань виконання встановлених наказом ДПАУ від 04.09.2009 р. N 487 "Про розрахункову базу на вересень 2009 року" завдань із забезпечення надходжень до бюджету податку на прибуток та ПДВ, достовірності формування показників структурними підрозділами податкового контролю юридичних осіб, погашення прострочених податкових зобов'язань, суттєві прорахунки в організації аналітичної роботи щодо оцінки ризиків невиконання надходжень до бюджету та низький рівень організації роботи по впровадженню нових підходів з адміністрування податків як з боку регіональних ДПА, так і підпорядкованих ДПІ завадили частині з них забезпечити виконання затверджених показників.

У більшості регіональних ДПА замість розробки ефективних заходів та надання ДПІ практичної допомоги в організації роботи здійснювались переважно командно-адміністративні заходи шляхом проведення нарад, заслуховувань, направлення значної кількості вказівок (телеграм, листів) щодо забезпечення виконання розрахункової бази, проведення тієї чи іншої роботи із звітування перед ДПА.

Крім того, в окремих регіональних ДПА не була організована належним чином робота підпорядкованих органів щодо здійснення ефективного контролю за додержанням платниками податків податкового законодавства, правильністю обчислення та повнотою нарахування і сплати платежів. Серед основних недоліків в організації роботи з адміністрування податків - відсутність ефективного контролю за підприємствами з низьким коефіцієнтом податкової віддачі, збитковими підприємствами, кількість яких в окремих регіонах збільшується, та підприємствами, які мають значні суми валових доходів і не сплачують податок на прибуток або сплачують у незначних розмірах, а також ті, які не декларують або декларують до сплати мізерні суми ПДВ.