ГНАУ направляет для сведения и использования в практической работе Методические рекомендации к порядку применения норм налогового законодательства по НДС в области сельхозпроизводства и обязует установить контроль за правильностью применения специальных режимов налогообложения в сельхозпроизводстве как в части определения, перечисления сумм НДС на специальные счета для приобретения МТР, поддержки животноводства и птицеводства, выплат дотаций сельхозпроизводителям, так и в части соблюдения СПД условий целевого использования полученных и оставленных в собственном распоряжении денежных средств.