Кабінетом Міністрів України 20 вересня 2006 року прийнято постанову N 1336 "Внесення змін до постанов Кабінету Міністрів України від 14 серпня 1996 р. N 944 та від 9 жовтня 1996 р. N 1247", якою внесено зміни до постанов про створення Державної компанії з експорту та імпорту продукції і послуг військового та спеціального призначення та про затвердження Статуту названої Компанії.

Внесеними змінами до зазначених постанов Кабінету Міністрів України Президента України, Раду національної безпеки і оборони України усунуто від вирішення питань діяльності Державної компанії з експорту та імпорту продукції і послуг військового та спеціального призначення.

Оскільки на Компанію покладено здійснення операцій з експорту та імпорту озброєння, боєприпасів, військової техніки, вибухових речовин, робіт і послуг військового та спеціального призначення, що безпосередньо пов'язано із забезпеченням національної безпеки і оборони України, усунення Президента України, Ради національної безпеки і оборони України від вирішення зазначених питань не відповідає Основному Закону України. За Конституцією України саме Президент України забезпечує національну безпеку України, здійснює керівництво у сферах національної безпеки та оборони (пункти 1 і 17 частини першої статті 106, Рада ж національної безпеки і оборони України є координаційним органом з питань національної безпеки і оборони при Президентові України (частина перша статті 107.