Кабінетом Міністрів України 1 липня 2009 року видано постанову N 664 "Про внесення змін до Положення про Міністерство оборони України", якою внесено зміни до Положення про Міністерство оборони України, затвердженого постановою Кабінету Міністрів України від 3 серпня 2006 року N 1080.

Пунктом 6 змін, що вносяться до Положення про Міністерство оборони України, абзац другий пункту 12 зазначеного Положення, яким було передбачено, що структуру центрального апарату Міністерства оборони України та положення про його структурні підрозділи затверджує Міністр, викладено у новій редакції, якою встановлено, що структуру центрального апарату Міністерства оборони України затверджує Міністр за погодженням з Першим віце-прем'єр-міністром України; положення про структурні підрозділи центрального апарату Міністерства оборони України затверджує Міністр.

Таким чином, Кабінет Міністрів України своєю постановою наділив Першого віце-прем'єр-міністра України повноваженням щодо погодження структури центрального апарату Міністерства оборони України, чим усупереч Конституції України розширив повноваження Першого віце-прем'єр-міністра України, закріплені на законодавчому рівні, зокрема, Законом України "Про Кабінет Міністрів України".

Відповідно до частини другої статті 6 Конституції України органи виконавчої влади, їх посадові особи здійснюють свої повноваження у встановлених Конституцією межах і відповідно до законів України. Частиною другою статті 19 Конституції України визначено, що органи державної влади, їх посадові особи зобов'язані діяти лише на підставі, в межах повноважень та у спосіб, що передбачені Конституцією та законами України.

Згідно з пунктом 12 частини першої статті 92 Конституції України організація і діяльність органів виконавчої влади визначаються виключно законами України. Згідно з частиною другою статті 120 Конституції України організація, повноваження і порядок діяльності Кабінету Міністрів України, інших центральних органів виконавчої влади визначаються Конституцією і законами України.

Ні Законом України "Про Кабінет Міністрів України", ні іншими законами України не передбачено погодження структури Міністерства оборони України Першим віце-прем'єр-міністром України.